保护区属温带大陆性极干旱荒漠气候，冬季严寒，夏季酷热，秋季凉爽。全年平均气温9.9℃，最热月7月为26.7℃，最冷月1月为-10.4℃。气温日较差大，最高达29℃。日照时间长，全年日照时数3246.7小时，日照率达73%。太阳总辐射全年为641.84千焦/平方厘米。年平均降水量39.9毫米。全年平均风速2.2米/秒。 [5]
