水利建设专项收入的计税依据主要是不含税的销售收入或营业收入。以下是具体分析：
一、计税依据的基本定义
水利建设专项收入是政府为筹集水利建设资金而设立的专项收入，其计税依据是确定纳税人应缴税额的基础。这一基础通常与纳税人的经济活动，特别是销售收入或营业收入密切相关。
二、计税依据的具体内容
不含税的销售收入或营业收入：企业在计算应缴纳的水利建设专项收入时，应以其实际实现的、不含税的销售收入或营业收入为基础。这意味着，计税依据是净收入，已经扣除了相关的税费。
计提比例：水利建设专项收入的计提比例是根据法律法规和政策文件确定的。各省市可能根据实际情况制定不同的计提比例，但总体上都是基于销售收入或营业收入的一定比例来计提的。例如，湖南省的计提比例为0.06%，而浙江省为0.01%。
特殊规定：对于包含应税项目的部分（如商品销售等），需要按照相关税收规定缴纳增值税等税费。此外，对于享受税收优惠政策的水利建设项目，其计税依据和计提比例也可能会有所不同。
三、计税依据的应用实践
在实际操作中，企业需要根据当地税务机关的要求和相关政策文件，准确计算并缴纳水利建设专项收入。为此，企业需要保留好相关的销售收入或营业收入证明文件（如财务报表、销售发票等），以便在税务机关进行核查时能够提供有力的证据支持。
综上所述，水利建设专项收入的计税依据是不含税的销售收入或营业收入，并受到计提比例和特殊规定的影响。企业在计算和缴纳时，应严格遵守相关法律法规和政策文件的规定。
